研究报告/Research Report

基于 SSR 标记的长柄扁桃种质遗传多样性分析  

包文泉1,2 , 左丝雨1 , 朱绪春1 , 高福玲3 , 杨绍彬1 , 乌云塔娜1*
1 中国林业科学研究院经济林研究开发中心, 郑州, 450003; 2 内蒙古农业大学林学院, 呼和浩特, 010018; 3 河南省经济林和林木种苗工作站,郑州, 450003
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2017年12月15日    接受日期: 2018年01月15日    发表日期: 2018年08月08日
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推荐引用:

引用格式:Bao W.Q., Zuo S.Y., Zhu X.C., Gao F.L., Yang S.B., and Wuyun T.N., 2018, Genetic diversity analysis of Amygdalus pedunculata germplasm resources based on SSR markers, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(14): 4721-4728 (包文泉, 左丝雨, 朱绪春, 高福玲, 杨绍彬, 乌云塔娜, 2018, 基于 SSR 标记的长柄扁桃种质遗传多样性分析, 分子植物育种, 16(14): 4721-4728)

摘要

利用 11 SSR 分子标记对长柄扁桃 10 个野生群体遗传多样性和遗传结构进行分析,11 SSR 引物共检测到 157 个等位基因(Na),各位点平均等位基因数(Na)和多态性信息含量(PIC)分别为 14.27 0.50;物种水平上的 Shannon's 信息指数(I)和期望杂合度(He)分别为 1.48 0.49。群体水平上的等位基因(Na)、有效等位基因(Ne)Shannon's 信息指数(I)、期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho)分别为 4.392.290.920.37 0.47;其中内蒙古喇嘛洞群体遗传多样性最丰富,而内蒙古湿壕乡群体遗传多样性最低。分子方差分析(AMOVA)显示长柄扁桃大部分遗传变异来自群体内 93%,群体间的遗传变异只占 7%。长柄扁桃群体遗传距离为 0.03~0.35,平均为 0.11;遗传相似度为 0.72~0.96,平均为 0.89;遗传相似度的聚类分析将供试 10 个群体划分为 4 组。研究结果表明,中国长柄扁桃资源具有丰富的遗传多样性,群体遗传分化程度适中,为长柄扁桃资源的合理保护与利用提供了科学依据。

关键词
长柄扁桃;SSR;遗传多样性

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《分子植物育种》印刷版
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